而印经院把各教派都认同的《甘珠尔》、《丹珠尔》从刻制到收藏更是格外小心在意，则是历代土司和印经院的管理者，为把德格印经院建成藏区的“藏传佛教印经中心”的孜孜追求。事实证明，他们做到了。德格版《甘珠尔》共计103卷，分为礼赞部、续部、般若、中观、经疏、唯识、俱舍、律部、本书、书翰、因明、声明、医方明、工巧明、续身部、杂部、阿底峡小部集、总目录，共计18大类。《甘珠尔》意为“佛语部”，记录的是佛教的经典和经律。与《甘珠尔》齐名的是《丹珠尔》。《丹珠尔》共计213卷，包括对律经的阐明、注疏、密教仪轨等分为：赞颂、咒释、经释等类。其中，“经释”分十二类：中观、注疏、瑜伽、小乘、本生、杂撰、因明、声明、医明、巧明、世论、补遗。《丹珠尔》意为“论疏部”，记录的则是对佛语、对经律的阐释以及论述。
藏传佛教的所有寺院，不论是任何教派，庙里没有《甘珠尔》和《丹珠尔》这两部经书，是不能想象的。德格印经院刻制的这两部经书，作为佛教经论的总集，不算前期的大量准备工作，从公元1730年老2月初3开始雕刻，经过60名书写员、10名编审师、400多名刻字工人的的艰苦劳动，到公元1734年才完成。据说，就为刻制此书版，“消耗青稞274932克，茶叶37417包”。因为质量好，全藏区的寺院纷至沓来，求购此书。因而竟有人风传，德格印经院“铸有《甘珠尔》铁版”，就连老外也信以为真。自称精通藏文、藏俗，在西藏呆了二十年的大卫 麦克唐纳（daivd macdonald）在他所著的《旅藏二十年》中写道：“在全境内，只为‘甘珠尔’专设一付铁板，这东西保存在喀木的德格地方”。